个人简历


更新日期:2008-5-7

刘长宁,博士,助理研究员
生物信息学研究组
中国科学院计算技术研究所
电子邮件: lcn at ict dot ac dot cn
联系电话:86-10-62600566 (O), ************** (M)

基本信息
籍贯:湖南,中国
性别:男
国籍:中华人民共和国
婚姻:已婚

教育背景
博士 2002 - 2007 生物信息,中科院计算所 导师:李国杰,陈润生
学士 1996 - 2000 生物学国家人才基地班,武汉大学 导师:黄诗笺
高级程序员 1998 国家信息产业部认证

研究经历
2007 - 至今 助理研究员,中国科学院计算技术研究所
2002 - 2007 研究助理,中国科学院计算技术研究所
2006.7 - 2007.1 访问学生,哈佛大学Dana-Farber癌症研究所

奖励和荣誉
2008 中科院卢嘉锡青年人才奖
2008 计算所优秀研究团队成员
2007 计算所百星计划成员
2007 中科院院长优秀奖学金
2007 中科院三好学生
2006 计算所所长特别奖学金
2006 中科院三好学生标兵
2006 中科院三好学生
2003 中科院研究生院优秀研究生奖学金
1999 武汉大学数学和生物学新星奖学金
1997 武汉大学丙等人民奖学金
1996 武汉大学丙等人民奖学金

研究兴趣
非编码基因
非编码基因的功能和进化
非编码基因调控网络
细胞网络
蛋白质相互作用网络,基因调控网络分析

已发表文章列表
01) MicroRNA-encoding long non-coding RNAs, BMC Genomics, 2008. ( 并列第一作者 )
02) MicroRNA regulation of messenger-like non-coding RNAs -- a network of mutual microRNA control, Trends in Genetics, 2008. ( 并列第一作者 )
03) Deriving the Probabilities of Water Loss and Ammonia Loss for Amino Acids from Tandem Mass Spectra, Journal of Proteome Research, 2008.
04) NONCODE v2.0: decoding the non-coding, Nucleic Acids Research, 2008. ( 并列第一作者 )
05) antiCODE: a natural sense-antisense transcripts database, BMC Bioinformatics, 2007.
06) Dynamic Changes in Subgraph Preference Profiles of Crucial Transcription Factors, PLoS Computational Biology, 2006. ( 并列第一作者 )
07) The DNA sequence, annotation and analysis of human chromosome 3, Nature, 2006.
08) NPInter: the Noncoding RNAs and Protein related bio- macromolecules Interaction database, Nucleic Acids Research, 2006.
09) Integrated analysis of multiple data sources reveals modular structure of biological networks, Biochemical and Biophysical Research Communications, 2006.
10) HPtaa database - potential target genes for clinical diagnosis and immunotherapy of human carcinoma, Nucleic Acids Research, 2006.
11) Identifying Hfq-binding small RNA targets in Escherichia coli, Biochemical and Biophysical Research Communications, 2006.
12) Organization of the Caenorhabditis elegans small non-coding transcriptome: Genomic features, biogenesis, and expression, Genome Research, 2006.
13) NONCODE: an integrated knowledge database of non-coding RNAs, Nucleic Acids Research, 2005. ( 第一作者 )

其他信息
编程语言:Perl, Python, C, Basic, PHP, JavaScript, Prolog, Unix Shell, R/S-plus, SQL.
兴趣爱好:足球,旅游,卡通,美食
Skype帐号:changning.liu
MSN帐号:My MSN: lcn at ict dot ac dot cn